MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 23339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013526	GATG	2	8	99	106	25 %	25 %	50 %	0 %	269838914
2	NC_013526	GGC	2	6	108	113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838914
3	NC_013526	TGC	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838914
4	NC_013526	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838914
5	NC_013526	CGA	2	6	168	173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838914
6	NC_013526	ATC	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838914
7	NC_013526	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838914
8	NC_013526	GAT	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838914
9	NC_013526	TCC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838915
10	NC_013526	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838915
11	NC_013526	GGA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838915
12	NC_013526	GAG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838915
13	NC_013526	CAG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838915
14	NC_013526	GCAG	2	8	415	422	25 %	0 %	50 %	25 %	269838915
15	NC_013526	TGG	2	6	453	458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838915
16	NC_013526	GCAG	2	8	460	467	25 %	0 %	50 %	25 %	269838915
17	NC_013526	GGA	2	6	472	477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838915
18	NC_013526	GCC	2	6	525	530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838915
19	NC_013526	CTG	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
20	NC_013526	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838916
21	NC_013526	CGC	2	6	616	621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
22	NC_013526	GGC	2	6	663	668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838916
23	NC_013526	CGC	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
24	NC_013526	CGT	2	6	711	716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
25	NC_013526	GC	3	6	717	722	0 %	0 %	50 %	50 %	269838916
26	NC_013526	CTC	2	6	779	784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
27	NC_013526	CTG	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
28	NC_013526	GCA	2	6	851	856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
29	NC_013526	GCA	2	6	897	902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
30	NC_013526	AGC	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
31	NC_013526	CCCA	2	8	1062	1069	25 %	0 %	0 %	75 %	269838916
32	NC_013526	CGGC	2	8	1070	1077	0 %	0 %	50 %	50 %	269838916
33	NC_013526	CCG	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
34	NC_013526	GC	3	6	1107	1112	0 %	0 %	50 %	50 %	269838916
35	NC_013526	GTC	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
36	NC_013526	GGC	2	6	1164	1169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838916
37	NC_013526	CAC	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838916
38	NC_013526	CGGC	2	8	1227	1234	0 %	0 %	50 %	50 %	269838916
39	NC_013526	CCG	2	6	1247	1252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
40	NC_013526	GCT	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
41	NC_013526	TCT	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838916
42	NC_013526	CGCA	2	8	1414	1421	25 %	0 %	25 %	50 %	269838916
43	NC_013526	GCA	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
44	NC_013526	CCG	2	6	1493	1498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
45	NC_013526	CCT	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
46	NC_013526	ACCTAC	2	12	1576	1587	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	269838916
47	NC_013526	GTC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
48	NC_013526	TCC	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
49	NC_013526	GAT	3	9	1749	1757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838916
50	NC_013526	CCTC	2	8	1760	1767	0 %	25 %	0 %	75 %	269838916
51	NC_013526	GGA	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
52	NC_013526	C	6	6	1790	1795	0 %	0 %	0 %	100 %	269838916
53	NC_013526	CCA	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838916
54	NC_013526	CAC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838916
55	NC_013526	AGCCC	2	10	1962	1971	20 %	0 %	20 %	60 %	269838916
56	NC_013526	CCG	2	6	1985	1990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
57	NC_013526	CAG	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
58	NC_013526	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838916
59	NC_013526	CAG	2	6	2143	2148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
60	NC_013526	TAC	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838916
61	NC_013526	GGT	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838916
62	NC_013526	CTC	2	6	2286	2291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838916
63	NC_013526	GCC	2	6	2299	2304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
64	NC_013526	GCC	3	9	2311	2319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838916
65	NC_013526	CAGG	3	12	2347	2358	25 %	0 %	50 %	25 %	269838916
66	NC_013526	ATC	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838916
67	NC_013526	AGG	2	6	2417	2422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
68	NC_013526	GGT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838916
69	NC_013526	GAG	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
70	NC_013526	ACG	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
71	NC_013526	GCA	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838916
72	NC_013526	GAG	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838916
73	NC_013526	ACG	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838917
74	NC_013526	GC	3	6	2800	2805	0 %	0 %	50 %	50 %	269838917
75	NC_013526	CTT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838917
76	NC_013526	CCA	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
77	NC_013526	GGT	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
78	NC_013526	CCA	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
79	NC_013526	TCGC	2	8	2935	2942	0 %	25 %	25 %	50 %	269838917
80	NC_013526	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838917
81	NC_013526	CTCC	2	8	3030	3037	0 %	25 %	0 %	75 %	269838917
82	NC_013526	GGT	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
83	NC_013526	GGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838917
84	NC_013526	CGA	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838917
85	NC_013526	ATG	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838917
86	NC_013526	C	6	6	3220	3225	0 %	0 %	0 %	100 %	269838917
87	NC_013526	TGG	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
88	NC_013526	CCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
89	NC_013526	GCC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838917
90	NC_013526	GAG	2	6	3404	3409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838917
91	NC_013526	CCT	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838917
92	NC_013526	GCG	2	6	3495	3500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838917
93	NC_013526	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838917
94	NC_013526	GAT	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838917
95	NC_013526	TCC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838917
96	NC_013526	TGG	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838917
97	NC_013526	CAC	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
98	NC_013526	TCG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838917
99	NC_013526	CCT	2	6	3735	3740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838917
100	NC_013526	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838917
101	NC_013526	CGGCCA	2	12	3762	3773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269838917
102	NC_013526	TG	3	6	3882	3887	0 %	50 %	50 %	0 %	269838917
103	NC_013526	CCT	2	6	3972	3977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
104	NC_013526	GAT	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838918
105	NC_013526	CCT	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
106	NC_013526	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838918
107	NC_013526	CGT	3	9	4137	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
108	NC_013526	CAG	3	9	4159	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
109	NC_013526	CTGC	2	8	4168	4175	0 %	25 %	25 %	50 %	269838918
110	NC_013526	AGG	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838918
111	NC_013526	TGC	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
112	NC_013526	GTC	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
113	NC_013526	CAG	2	6	4369	4374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
114	NC_013526	AGC	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
115	NC_013526	AGT	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838918
116	NC_013526	AGC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838918
117	NC_013526	TGG	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838918
118	NC_013526	TGC	2	6	4562	4567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
119	NC_013526	CCT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
120	NC_013526	GCG	2	6	4625	4630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838918
121	NC_013526	TCA	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838918
122	NC_013526	CGG	2	6	4701	4706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838918
123	NC_013526	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838918
124	NC_013526	GTC	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838918
125	NC_013526	CTC	2	6	4843	4848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
126	NC_013526	CGG	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838918
127	NC_013526	CCA	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838918
128	NC_013526	CTC	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838918
129	NC_013526	CA	3	6	4913	4918	50 %	0 %	0 %	50 %	269838918
130	NC_013526	TCT	2	6	4953	4958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838918
131	NC_013526	GGA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838919
132	NC_013526	CCT	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838919
133	NC_013526	CCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838919
134	NC_013526	GTG	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838919
135	NC_013526	CGC	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838919
136	NC_013526	TCG	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838919
137	NC_013526	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838919
138	NC_013526	CGCCC	2	10	5410	5419	0 %	0 %	20 %	80 %	269838919
139	NC_013526	AGC	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838919
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141	NC_013526	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838919
142	NC_013526	GCC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838919
143	NC_013526	ACGC	2	8	5625	5632	25 %	0 %	25 %	50 %	269838919
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145	NC_013526	AGC	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838919
146	NC_013526	ACGA	2	8	5693	5700	50 %	0 %	25 %	25 %	269838919
147	NC_013526	ATG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838919
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149	NC_013526	CTC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838919
150	NC_013526	CGGG	2	8	5829	5836	0 %	0 %	75 %	25 %	269838919
151	NC_013526	ACC	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838919
152	NC_013526	GGCC	2	8	5907	5914	0 %	0 %	50 %	50 %	269838919
153	NC_013526	AGA	2	6	5937	5942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838919
154	NC_013526	ATG	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838919
155	NC_013526	GCCA	2	8	6041	6048	25 %	0 %	25 %	50 %	269838919
156	NC_013526	GCC	3	9	6055	6063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838919
157	NC_013526	GGA	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838919
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159	NC_013526	CCT	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838919
160	NC_013526	CCCA	2	8	6167	6174	25 %	0 %	0 %	75 %	269838919
161	NC_013526	TGA	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838919
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164	NC_013526	TTC	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838919
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168	NC_013526	ACC	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838919
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172	NC_013526	TCG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838919
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202	NC_013526	CTG	2	6	8594	8599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838923
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259	NC_013526	GCC	2	6	11025	11030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838926
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261	NC_013526	CTC	2	6	11043	11048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838926
262	NC_013526	GTG	2	6	11076	11081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838926
263	NC_013526	CCT	2	6	11144	11149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838926
264	NC_013526	CCT	2	6	11169	11174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838926
265	NC_013526	CTCCAG	2	12	11184	11195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269838926
266	NC_013526	GC	3	6	11217	11222	0 %	0 %	50 %	50 %	269838926
267	NC_013526	AGC	2	6	11224	11229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838926
268	NC_013526	TGG	3	9	11261	11269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838926
269	NC_013526	TGG	2	6	11273	11278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838926
270	NC_013526	GCC	2	6	11281	11286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838926
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278	NC_013526	ACC	2	6	11629	11634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838926
279	NC_013526	CCGC	2	8	11663	11670	0 %	0 %	25 %	75 %	269838926
280	NC_013526	GGC	2	6	11682	11687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838926
281	NC_013526	CCCT	2	8	11788	11795	0 %	25 %	0 %	75 %	269838926
282	NC_013526	CAG	2	6	11895	11900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838926
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285	NC_013526	TGC	2	6	12546	12551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838927
286	NC_013526	GGT	2	6	12620	12625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838927
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293	NC_013526	CGT	2	6	13229	13234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838929
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389	NC_013526	GGA	2	6	18154	18159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838932
390	NC_013526	GAA	2	6	18193	18198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838932
391	NC_013526	CG	3	6	18201	18206	0 %	0 %	50 %	50 %	269838932
392	NC_013526	GGC	2	6	18351	18356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838932
393	NC_013526	AGG	2	6	18360	18365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838932
394	NC_013526	GGC	2	6	18426	18431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838932
395	NC_013526	TGC	2	6	18438	18443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838932
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397	NC_013526	AGC	2	6	18546	18551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838932
398	NC_013526	GA	3	6	18556	18561	50 %	0 %	50 %	0 %	269838932
399	NC_013526	CCCAAC	2	12	18569	18580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838932
400	NC_013526	AAC	2	6	18593	18598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269838932
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402	NC_013526	CTACGG	2	12	18712	18723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269838932
403	NC_013526	TGGA	2	8	18740	18747	25 %	25 %	50 %	0 %	269838932
404	NC_013526	AGG	2	6	18879	18884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838932
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409	NC_013526	GGA	2	6	19108	19113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838933
410	NC_013526	TTC	2	6	19133	19138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269838933
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412	NC_013526	CT	4	8	19147	19154	0 %	50 %	0 %	50 %	269838933
413	NC_013526	CCAC	2	8	19162	19169	25 %	0 %	0 %	75 %	269838933
414	NC_013526	CTTC	2	8	19215	19222	0 %	50 %	0 %	50 %	269838933
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421	NC_013526	GACCT	2	10	19388	19397	20 %	20 %	20 %	40 %	269838933
422	NC_013526	ACC	2	6	19404	19409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838933
423	NC_013526	GCCG	2	8	19459	19466	0 %	0 %	50 %	50 %	269838933
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482	NC_013526	CTG	2	6	22047	22052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838936
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490	NC_013526	AG	3	6	22556	22561	50 %	0 %	50 %	0 %	269838937
491	NC_013526	GTGGA	2	10	22568	22577	20 %	20 %	60 %	0 %	269838937
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497	NC_013526	GTG	2	6	23080	23085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838938
498	NC_013526	GCTG	2	8	23123	23130	0 %	25 %	50 %	25 %	269838938
499	NC_013526	GAG	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838938
500	NC_013526	GT	3	6	25018	25023	0 %	50 %	50 %	0 %	269838939

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